Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf3Q60765 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms