Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mkrn3Q60764 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms