Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprnQ60673 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms