Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Slc5a6Q5U4D8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Slc5a6Q5U4D8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Slc5a6Q5U4D8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Slc5a6Q5U4D8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Slc5a6Q5U4D8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms