Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm27Q5SFM8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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