Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trp53i11Q4QQM4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms