Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Shank3Q4ACU6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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