Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lrrc43Q3V0L5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc43Q3V0L5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms