Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm27235Q3UW50 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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