Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gm28047Q3US59 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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