Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms