Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Parp3Q3ULW8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms