Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc33Q3ULW6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms