Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Edc4Q3UJB9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms