Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Lrrc58Q3UGP9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Lrrc58Q3UGP9 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lrrc58Q3UGP9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lrrc58Q3UGP9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lrrc58Q3UGP9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lrrc58Q3UGP9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms