Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44706-201ENSMUST00000206822 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b26-201ENSMUST00000085623 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtpbp6Q3U6U5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms