Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q3U6N9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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