Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ssbp4Q3U4B1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ssbp4Q3U4B1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ssbp4Q3U4B1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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