Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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