Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccndbp1Q3TVC7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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