Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ctdnep1Q3TP92 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctdnep1Q3TP92 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ctdnep1Q3TP92 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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