Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fam107bQ3TGF2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms