Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms