Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cers3Q1A3B0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers3Q1A3B0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms