Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rpusd3Q14AI6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rpusd3Q14AI6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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