Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Spatc1Q148B6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms