Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms