Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Pate4Q09098 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Pate4Q09098 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms