Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp2Q08652 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms