Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cnn2Q08093 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnn2Q08093 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnn2Q08093 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnn2Q08093 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms