Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Siah1bQ06985 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms