Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Sh3bp2Q06649 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bp2Q06649 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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