Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aplp2Q06335 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms