Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cab39Q06138 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms