Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sox12Q04890 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms