Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Emx2Q04744 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms