Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cxcr5Q04683 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms