Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Tff2Q03404 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tff2Q03404 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms