Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Msx2Q03358 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms