Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms