Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nme2Q01768 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms