Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
EgfrQ01279 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms