Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Apoa1Q00623 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms