Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SgcdP82347 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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