Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Irx1P81068 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Irx1P81068 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Irx1P81068 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Irx1P81068 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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