Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ptprn2P80560 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ptprn2P80560 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ptprn2P80560 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Ptprn2P80560 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ptprn2P80560 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ptprn2P80560 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ptprn2P80560 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ptprn2P80560 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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