Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pkn1P70268 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pkn1P70268 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms