Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snrpd1P62315 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms