Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rps11P62281 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rps11P62281 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms