Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nphp4P59240 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms